Scala IDEを入れるとeclipseの標準出力が切り替わる件について

ある時からプラグインの開発時に別プロセスでeclipseを起動してもスタックトレースやらSystem.out.printlnを始め標準出力が一切出なくなった。これが出ないとマジで仕事にならないのでとりあえず調査した。
eclipse->Preferencesで開いたダイアログの、Scala>Logging設定に"Redirect standard out/err to log file."というチェックボックスを発見した。これにチェックが入っていると標準出力をログファイルに切り替えるようだ。ちなみにデフォルトでチェックが入っている。

Scala IDEのチケットに挙げてる人もいた。
Eager redirect of other plugins output

うーん、こういう勝手に設定変えるのはどうかと思うのだが...。